Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERPUD1Q15011 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERPUD1Q15011 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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