Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 PRKCSH-210ENST00000589990 567 ntTSL 214.48□□□□□ -0.097e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.237e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.367e-12■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.498e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.028e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.098e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 24.74□□□□□ -1.658e-9■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPL11-203ENST00000458455 721 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.373e-26■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPL11-205ENST00000482370 879 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.963e-26■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPL11-201ENST00000374550 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-26■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 28.42□□□□□ -1.063e-26■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 523.01■■□□□ 1.272e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 517.99■□□□□ 0.472e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-215ENST00000560599 1426 ntTSL 518■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-213ENST00000560269 569 ntTSL 412.87□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EIF2B3-203ENST00000372183 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-207ENST00000519662 811 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-208ENST00000521516 2216 ntTSL 29.37□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-201ENST00000287701 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 EIF2B3-204ENST00000439363 892 ntTSL 37.07□□□□□ -1.283e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-214ENST00000560357 979 ntTSL 26.69□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.643e-6■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-214ENST00000435234 1047 ntTSL 314.53□□□□□ -0.085e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-217ENST00000445378 566 ntTSL 414.49□□□□□ -0.095e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.365e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.385e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-218ENST00000452242 980 ntTSL 511.9□□□□□ -0.55e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-205ENST00000409453 2552 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.855e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-212ENST00000425485 622 ntTSL 36.83□□□□□ -1.325e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.465e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.515e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.565e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.65e-8■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-208ENST00000573251 894 ntTSL 38.72□□□□□ -1.011e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-206ENST00000572090 759 ntTSL 37.51□□□□□ -1.211e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-203ENST00000570767 871 ntTSL 56.66□□□□□ -1.341e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-205ENST00000571988 509 ntTSL 36.13□□□□□ -1.431e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-211ENST00000574287 485 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RSL1D1-210ENST00000573791 520 ntTSL 45.49□□□□□ -1.531e-19■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.078e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-206ENST00000494077 781 ntTSL 212.43□□□□□ -0.428e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-203ENST00000464218 615 ntTSL 512.39□□□□□ -0.438e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-201ENST00000326199 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.688e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-202ENST00000344700 650 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.688e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 RPS10-204ENST00000467531 777 ntTSL 210.8□□□□□ -0.688e-7■□□□□ 9.1
PUM1Q14671 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.65□□□□□ -1.181e-19■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 27.35□□□□□ -1.231e-19■□□□□ 9
PUM1Q14671 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.12□□□□□ -1.271e-19■□□□□ 9
PUM1Q14671 GPX4-205ENST00000587932 274 ntTSL 229.2■■■□□ 2.261e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 GPX4-202ENST00000585362 859 ntTSL 227.16■■□□□ 1.941e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 LTBP4-224ENST00000599016 726 ntTSL 321.44■■□□□ 1.021e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 LTBP4-227ENST00000600026 723 ntTSL 321.44■■□□□ 1.021e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 320.95■□□□□ 0.941e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-211ENST00000491520 723 ntTSL 520.74■□□□□ 0.911e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 219.98■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX27-202ENST00000462328 824 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 517.43■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 217.41■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 517.2■□□□□ 0.341e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-209ENST00000483431 712 ntTSL 516.96■□□□□ 0.311e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.231e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-210ENST00000487669 736 ntTSL 316.1■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 514.92□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL18A-202ENST00000597648 683 ntTSL 314.9□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 314.9□□□□□ -0.021e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 514.29□□□□□ -0.121e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.37□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 DDX27-205ENST00000493252 825 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CSDE1-215ENST00000533818 552 ntTSL 412.89□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 NUMA1-223ENST00000542977 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.65□□□□□ -0.381e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 312.15□□□□□ -0.461e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 311.99□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 511.38□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.651e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 59.43□□□□□ -0.91e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.141e-7■□□□□ 9
PUM1Q14671 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 46.85□□□□□ -1.311e-7■□□□□ 9
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 361.4 ms