Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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ZNF235Q14590 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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ZNF235Q14590 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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ZNF235Q14590 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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ZNF235Q14590 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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ZNF235Q14590 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF235Q14590 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms