Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBA3CQ13748 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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