Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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CUL4AQ13619 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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