Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOP3AQ13472 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOP3AQ13472 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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