Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDE3BQ13370 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDE3BQ13370 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms