Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJC3Q13217 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DNAJC3Q13217 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms