Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CBX3Q13185 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CBX3Q13185 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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