Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SYCNQ0VAF6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms