Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCBP1Q09161 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms