Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CYP4F3Q08477 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms