Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIN1Q05586 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms