Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RELAQ04206 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RELAQ04206 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RELAQ04206 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RELAQ04206 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms