Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CENPEQ02224 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPEQ02224 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms