Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms