Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDK17Q00537 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms