Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK16Q00536 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK16Q00536 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms