Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB25P57735 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB25P57735 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB25P57735 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms