Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAG2P55895 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAG2P55895 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms