Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms