Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELLP55199 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELLP55199 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELLP55199 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELLP55199 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELLP55199 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELLP55199 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELLP55199 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ELLP55199 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms