Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
RAD23AP54725 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms