Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ETV1P50549 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV1P50549 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV1P50549 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV1P50549 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ETV1P50549 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ETV1P50549 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ETV1P50549 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms