Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP4P49662 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP4P49662 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms