Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR4P46093 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GPR4P46093 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GPR4P46093 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms