Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2IP36954 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms