Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THBS4P35443 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THBS4P35443 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THBS4P35443 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms