Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GJB2P29033 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB2P29033 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB2P29033 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GJB2P29033 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJB2P29033 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms