Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRR1P24046 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRR1P24046 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms