Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB1P23443 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB1P23443 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms