Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA6P23229 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms