Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PVALBP20472 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PVALBP20472 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PVALBP20472 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms