Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRHP20396 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRHP20396 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRHP20396 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRHP20396 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRHP20396 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRHP20396 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRHP20396 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRHP20396 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms