Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
IFITM1P13164 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms