Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAA2P0DJI9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms