Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms