Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA4P05014 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms