Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-AP01891 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms