Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TOMM40O96008 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TOMM40O96008 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms