Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYF2O95926 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYF2O95926 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms