Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDNO94850 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDNO94850 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDNO94850 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDNO94850 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDNO94850 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDNO94850 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DDNO94850 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DDNO94850 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DDNO94850 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDNO94850 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDNO94850 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDNO94850 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDNO94850 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDNO94850 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms