Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PITX3O75364 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PITX3O75364 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PITX3O75364 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms