Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EDIL3O43854 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EDIL3O43854 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms