Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms