Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBDO15205 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBDO15205 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBDO15205 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBDO15205 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBDO15205 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBDO15205 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms