Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CLGNO14967 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CLGNO14967 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CLGNO14967 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms