Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCRIP1C9JLW8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms