Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEURL1BA8MQ27 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEURL1BA8MQ27 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms