Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms